Следственные изоляторы как самостоятельные учреждения в нашей стране появились в 1963 году. Следственный изолятор № 2 УФСИН России по Астраханской области был образован на базе зданий и сооружений ликвидированного лечебно-трудового профилактория № 2 (города Нариманова) на основании приказа МВД Российской Федерации от 20 мая 1992 года и ему было присвоено название Учреждение ИЗ-25/2 с лимитом наполнения 510 человек.

За последние годы введено в эксплуатацию здание малосемейного общежития для сотрудников, также был открыт участок для ловли рыбы «Золотая тоня» и оборудована база отдыха для личного состава, имеются посевные земли, на, которых выращиваются разнообразные сорта астраханских овощных культур, в 2007 году при содействии администрации Наримановского района установлена система капельного орошения.

В соответствии с программой расширения следственных изоляторов на протяжении трех лет лимит наполнения учреждения увеличился до 771 (семьсот семьдесят одной), единицы, введен в эксплуатацию отдельный корпус для осужденных отряда по хозяйственному обслуживанию, завершено строительство основного режимного корпуса на 450 мест, что говорит о создании дополнительных улучшенных условий содержания лиц под стражей, а также расширения численности коллектива.